中国外交部部长李肇星24日在十届全国人大常委会第二十五次会议上说，上海合作组织秘书处于2004年1月在北京启动，随着上海合作组织各领域合作不断深入和拓展，对外交往日趋活跃，秘书处的工作面临着一些新情况和新问题。

　　李肇星说：“成员国建议加强秘书处的职能，使其在协调该组织框架内活动、促进有关合作的开展、推动国际交往等方面发挥更大作用。”

　　议定书于2006年6月在上海签署，主要内容包括：重新定位上海合作组织秘书处的职能，规定秘书处是该组织主要的常设执行机构，为该组织活动提供协调、信息分析、法律和组织技术保障，就开展该组织框架内的合作和国际交往提出建议，监督该组织各机构决议的执行；对《上海合作组织宪章》中涉及秘书处负责人职务名称的条款作出了修改，将“主任”改为“秘书长”等。

　　全国人大外事委员会认为，议定书的签署和生效将为推动上海合作组织在维护地区安全稳定、促进成员国共同发展方面发挥更加积极的作用，符合中国的利益。