“本硕博连读是不是最好的人才培养机制还值得探讨”，上海交通大学研究生院常务副院长杜朝辉指出，那些好的专业，适应经济发展为社会急需的专业，本科生一般不愿意本硕连读或硕博连读，而长线专业或基础专业本硕博连读的学生会很多，而这并不一定都是学校最优秀的学生。因此，这一培养机制有可能不能选拔到最优秀的人才。山东大学研究生院常务副院长刘树伟说，最优秀的学生一般都不愿意在本校进行推优，所以他们学校的办法是拿出8%的计划调剂外校生源。

　　清华大学研究生院常务副院长陈皓明也认为，本硕连读会让学生进取心丧失，导致考试不及格率上升。同时，由于少了毕业论文的撰写、修改和答辩，缺少专门的写作训练，会使硕士阶段的论文质量下降。“人才培养要服从人才成长的内在规律，这样的做法对学风建设没有好处，学生培养和训练也缺乏应有的环境，不宜采用”。

　　“硕博连读在硕士一年级就决定不太科学，学生的学术能力需要两年左右才能看出来”，西安电子科技大学研究生院常务副院长姬红兵建议，“连读最好改在硕士阶段毕业前申请”。